高能所于1978年首批恢復研究生招生，是1981年國務院學位委員會批準的首批博士、碩士學位授予權單位之一，1996年物理學被首批批準按一級學科授予學位。1978年至2020年底，高能所共培養(yǎng)博士研究生1363名，碩士研究生690名。目前，在學研究生700人，其中博士研究生410人，碩士研究生290人。高能所現有導師636人，其中博導202人，碩導434人。 

　　1982年高能所培養(yǎng)出我國歷史上第一位理學博士馬中騏。他1993年被國務院學位委員會評為博士生導師，被國家教委和國務院學位委員會評為“做出突出貢獻的中國博士學位獲得者”，曾任高能所四室研究員，所學術委員會委員和所學位委員會主任。我所培養(yǎng)的研究生中,獲全國百篇優(yōu)秀博士學位論文有3人，獲中國科學院優(yōu)秀博士學位論文的博士研究生14人。 

　　1981 年11月3日，高能所理論物理、粒子物理與原子核物理博士、碩士培養(yǎng)點獲得國務院批準設立。高能所現有理論物理、粒子物理與原子核物理等6個理學博士（碩士）培養(yǎng)點，核技術及應用等2個工學博士（碩士）培養(yǎng)點，電子信息與機械2個全日制工程碩士培養(yǎng)點。  

　　建所時教育管理的工作內容主要是職工的繼續(xù)教育和培訓，恢復招生后陸續(xù)開始了招生、培養(yǎng)等各環(huán)節(jié)的工作。教育處目前的主要職責是貫徹執(zhí)行國家、中科院有關教育工作的政策和規(guī)定，起草本所研究生工作的規(guī)章制度并組織實施。根據所學位評定委員會的要求，組織研究生培養(yǎng)點的增列和評估工作；組織遴選研究生導師和導師培訓；負責研究生（含外籍）招生、學籍、培養(yǎng)、學位、畢業(yè)就業(yè)、獎評、社會實踐、聯合培養(yǎng)本科生、檔案等管理工作；協助核科學與技術學院、近代物理系做好研究生（含本科生）的課程建設和教學管理工作。